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乳癌預後預測模型:多元臨床數據之應用及多重演算法之模型比較
Other Title
Breast Cancer Prognostic Prediction Model: Application of Multiple Clinical Information and Comparison of Multiple Algorithms
Type
thesis
Date Issued
2022-07-28
Author(s)
王鈞榕
Advisor
鄭幼文;林若凱
Subjects
系所名稱:藥學系碩士班
Publisher
藥學系碩士班
Description
口試委員:許明暉 Hsu, Min-Huei ;張資昊 Chang, Tzu-Hao ;洪進昇 Hung, Chin-Sheng ;鄭幼文 Cheng, Yu-Wen;林若凱 Lin, Ruo-Kai
網際網路,開放日期為2022-08-13
網際網路,開放日期為2022-08-13
Abstract
研究背景:
乳癌自2020年成為全球最為好發的癌症,在女性族群中,發生率和死亡率皆位居全癌別第一,每年約造成230萬新診斷案例,68萬人死亡。乳癌有高度異質性,歐美國家與亞洲國家在好發年齡和分子亞型有顯著不同,近年人工智慧蓬勃發展,利用大數據建立精確的疾病預後預測模型,已然是現代顯學,過去文獻多以年齡、種族、腫瘤期別為研究族群,少見以乳癌特定用藥建立預測模型。
研究目的:
(1)臺灣乳癌病患確診後五年存活預測模型
(2)臺灣早期乳癌病人使用化學治療用藥-Epirubicin、Cyclophosphamide和Docetaxel後之三年疾病進展預測模型
(3)臺灣乳癌病人之復發預測及因子探討
研究方法:
本研究使用臺北醫學大學臨床數據中心提供之2000年1月至2019年12月間之ICD-O-3為C50.0-C50.9的乳癌患者為研究對象。分別以病患確診日和病患首次使用化學治療為標誌日期,以五年內死亡和三年內發生疾病進展(復發、轉移)為預測目標,並以人口學因子、疾病情境、疾病史、長期用藥史、檢驗檢查史、術後資訊作為特徵,建立羅吉斯回歸、決策樹、隨機森林、支援向量機、梯度提升和類神經網路模型,以SAS進行統計資料分析、特徵選取,並以SAS VIYA和R建立機器學習預測模型,後以AUC-ROC、Accuracy、Sensitivity、Specificity值為主要評估模型效能準則。
研究結果:
在目標一「乳癌病患確診後五年存活預測」而言,總共納入5,503位病患,以梯度提升模型表現最佳,AUC值可達0.843,重要特徵前五名為臨床期別組合、診斷年齡、腫瘤大小、臨床N和ER。目標二「早期乳癌病患使用Epirubicin、Cyclophosphamide和Docetaxel後之三年疾病進展預測」,共納入687人,以支援向量機模型表現最佳,AUC值為0.695,重要特徵依序為區域淋巴結侵犯數目、PR、嚼檳榔、診斷年齡和手術。目標三「乳癌病人之復發預測及因子探討」共納入5,866人,羅吉斯回歸模型和支援向量機模型表現佳,Accuracy值達0.954,重要特徵包含診斷年齡、病理期別組合、賀爾蒙治療。
研究結論:
在臺灣乳癌病患五年存活預測方面,梯度提升模型可以結合乳癌相關特徵和共病症情形,建立預測效能優異的模型。而早期乳癌病患使用Epirubicin、Cyclophosphamide和Docetaxel之三年疾病進展預測模型,因樣本過小,其預測效能仍有待收集更多樣本後進行確認。對臺灣乳癌患者而言,影響復發的風險因子以診斷年齡、病理期別組合、賀爾蒙治療為重。
乳癌自2020年成為全球最為好發的癌症,在女性族群中,發生率和死亡率皆位居全癌別第一,每年約造成230萬新診斷案例,68萬人死亡。乳癌有高度異質性,歐美國家與亞洲國家在好發年齡和分子亞型有顯著不同,近年人工智慧蓬勃發展,利用大數據建立精確的疾病預後預測模型,已然是現代顯學,過去文獻多以年齡、種族、腫瘤期別為研究族群,少見以乳癌特定用藥建立預測模型。
研究目的:
(1)臺灣乳癌病患確診後五年存活預測模型
(2)臺灣早期乳癌病人使用化學治療用藥-Epirubicin、Cyclophosphamide和Docetaxel後之三年疾病進展預測模型
(3)臺灣乳癌病人之復發預測及因子探討
研究方法:
本研究使用臺北醫學大學臨床數據中心提供之2000年1月至2019年12月間之ICD-O-3為C50.0-C50.9的乳癌患者為研究對象。分別以病患確診日和病患首次使用化學治療為標誌日期,以五年內死亡和三年內發生疾病進展(復發、轉移)為預測目標,並以人口學因子、疾病情境、疾病史、長期用藥史、檢驗檢查史、術後資訊作為特徵,建立羅吉斯回歸、決策樹、隨機森林、支援向量機、梯度提升和類神經網路模型,以SAS進行統計資料分析、特徵選取,並以SAS VIYA和R建立機器學習預測模型,後以AUC-ROC、Accuracy、Sensitivity、Specificity值為主要評估模型效能準則。
研究結果:
在目標一「乳癌病患確診後五年存活預測」而言,總共納入5,503位病患,以梯度提升模型表現最佳,AUC值可達0.843,重要特徵前五名為臨床期別組合、診斷年齡、腫瘤大小、臨床N和ER。目標二「早期乳癌病患使用Epirubicin、Cyclophosphamide和Docetaxel後之三年疾病進展預測」,共納入687人,以支援向量機模型表現最佳,AUC值為0.695,重要特徵依序為區域淋巴結侵犯數目、PR、嚼檳榔、診斷年齡和手術。目標三「乳癌病人之復發預測及因子探討」共納入5,866人,羅吉斯回歸模型和支援向量機模型表現佳,Accuracy值達0.954,重要特徵包含診斷年齡、病理期別組合、賀爾蒙治療。
研究結論:
在臺灣乳癌病患五年存活預測方面,梯度提升模型可以結合乳癌相關特徵和共病症情形,建立預測效能優異的模型。而早期乳癌病患使用Epirubicin、Cyclophosphamide和Docetaxel之三年疾病進展預測模型,因樣本過小,其預測效能仍有待收集更多樣本後進行確認。對臺灣乳癌患者而言,影響復發的風險因子以診斷年齡、病理期別組合、賀爾蒙治療為重。