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以台灣癌症登記為例建構相容於caBIG™技術之台灣區網格點
Other Title
The TCR Cancer Registry – a case study of caCORE based data standards implementation to integrate with the Cancer Biomedical Informatics Grid
Type
thesis
Date Issued
2011-06-23
Author(s)
陳新博
Advisor
徐建業
Subjects
系所名稱:醫學資訊研究所
Description
學位別:碩士
語文別:中文
指導教授:徐建業
共同指導教授:
口試委員:黃衍文;蘇家玉
中文關鍵字:癌症登記;格網系統;caBIG;caCORE;通用資料元;caDSR;共通互用性
語文別:中文
指導教授:徐建業
共同指導教授:
口試委員:黃衍文;蘇家玉
中文關鍵字:癌症登記;格網系統;caBIG;caCORE;通用資料元;caDSR;共通互用性
Abstract
caBIG是一個資訊網路工具;其允許研究組織及個體能輕易地分享、整合及分析資料。caBIG已經開發了一個全共通互用性的IT網絡系統,能輔助加乘整體癌症研究領域。台灣癌症登記起始於1979年,為行政院衛生署國民健康局所規畫並資助,50床以上的醫院強制申報新發癌症個案記載於癌症登記資料庫。台灣癌症登記由癌症登記顧問團隊協助,涵蓋16個不同領域之專家成員。台灣癌症登記主要目標為調查台灣癌症發生率。美國NCICB已建立一個caCORE核心技術;我們期望建立一個語法及語意共通互用的生醫資訊統並使其相容於caCORE架構。caCORE架構包含三個主要原件: (1) Enterprise Vocabulary Services (EVS);(2) cancer Data Standards Repository (caDSR);(3) caCORE SDK 及相關模型驅動系統的工具。由於現今並無台灣癌症登記之電子資料標準,發展一個相容於caBIG國際標準格式對台灣癌症研究領域是非常需要的。在本研究中,我們提供了一個以台灣癌症登記族群資料庫的案例實作,以caCORE基礎技術來實現之。透過此建構過程,我們期望建立一個台灣區網格點;以六大步驟:(1) 建立「台灣癌症登記資訊模型」;(2) 語意化註記動作;(3) 轉化資訊模型為中繼資料;(4) 格網系統核心元碼生成;(5) 系統相容性覆核;(6) 完成部屬caBIGTM系統網格點。藉由語意模型方法學,台灣癌症登記可成為癌症研究的電子資料標準。現今,我們以caCORE技術為基礎建立了癌症資料標準的原型,包含癌症資訊格網系統及台灣區網格點,而標準化通用資料元也完成釋出並公開查詢;未來我們將持續發展癌症相關資料元及應用至臨床醫學或轉譯領域。