建立一個各基因資料庫間的基因名稱導航與微陣列平台之註解系統:DIPILEX

Microarray 和其他計算基因表現的技術通常會得到成千上萬的基因數據，正
確的基因註解資料可幫助生物醫學專家做更複雜的研究。然而，基因相關
資訊太過複雜，使得專家們對於手上大量的基因註解工作有很大的困擾。
這個工作的困難點，在於很難整理各個基因資料庫的identifier 彼此間的對
應關係，來產生正確的註解資料。因此，我們開發DIPLEX 來提供自動化
註解的服務，並整合基因表現數據與生化調控路徑（biochemical pathways）
資訊，幫助生物醫學專家做多樣化的研究。在類似的研究中以NCI 所開發
的MatchMiner 最為有名，而我們使用不同於MatchMiner 的演算法，以NCBI
Entrez GeneID 為主要的Identifier 來建立各資料之間的關聯，將使用者所輸
入的基因identifier 轉為Entrez GeneID，再以Entrez GeneID 來擷取使用者
所需要的註解資訊。透過這樣的演算法，我們一併整合了KEGG 和Biocarta
Pathway Database 的資料，統計出使用者所上傳的基因名單（Gene list）所
相關的pathway。