建立免疫組庫定序平台並應用於A型免疫球蛋白腎病變及胰臟癌之診斷

免疫組庫被定義為在人體後天免疫系統中T細胞受體和B細胞受體的總和。免疫庫的多樣性首先源於T細胞受體（TCR）和B細胞受體（BCR）的V(D)J重排、隨機插入、缺失和替換。在受到病原體感染、自身免疫性疾病和癌症等疾病的抗原刺激後，免疫組庫的組成也會被改變。因此，研究免疫組庫可以讓我們更深入地了解疾病的進展或治療。免疫組庫定序平台的起始材料包括DNA和RNA，因此又分為以DNA為原料和以RNA為原料的方法。然而，目前的知識差距是我們需要一種工具來構建免疫組庫，並且對A型免疫球蛋白腎病變和胰臟癌中疾病和免疫的關聯仍然缺乏了解。
在我們的研究中，我們有三個目標。首先，我們旨在建立一個以DNA為原料的T細胞受體定序(TCR-seq)平台和一個以RNA為原料的B細胞受體定序(BCR-seq)平台，並將這些方法分別應用於A型免疫球蛋白腎病和胰臟癌的臨床研究。其次，我們旨在分析 A型免疫球蛋白腎病中的B細胞受體組庫。第三，我們旨在探討胰臟癌中的T細胞受體組庫。
結果顯示，以RNA為原料的B細胞受體定序平台具有組裝率大於60%、通用性和再現性的特色。結果顯示，以DNA為原料的T細胞受體定序平台具有7.93%至74.88%的組裝率且與以RNA為原料的方法相比有0.109至0.575的相似性。在對IgAN和非IgAN患者的B細胞受體組庫進行分析後，我們有幾個重要的發現，例如IgAN患者中IgA、IgD、IgM、IgL和IgK的多樣性較高、IgAN患者中IgK/IgL的比率較低、我們發現IgAN和非IgAN 患者之間的幾個基因使用頻率不同，包括IGLV2-18、IGLV5-48、IGLV8-61、IGLJ1、IGLJ5和IGKV1-13。在對T細胞受體組庫進行探討後，我們有幾個顯著的發現，例如周邊血的多樣性高於腫瘤和正常組織、早期患者的腫瘤組織多樣性高於晚期患者、腫瘤組織多樣性高的患者整體存活比低的患者更好以及我們使用公共克隆型參數的中位數可以顯著區分整體存活率。
總結來說，我們成功開發了兩個免疫組庫定序平台，並將其應用於臨床研究，發現了一些可能有利於A型免疫球蛋白腎病變和胰臟癌之預測和診斷的重要結果。
關鍵詞: 免疫基因定序;免疫基因組庫; A型免疫球蛋白腎病變;胰臟癌; B細胞受體;T細胞受體