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基因連續性分析應用於基因表現之資料探勘
Type
conference
Date Issued
2007
Author(s)
施宗牧
莊麗月
谷德倫
張慧朗
張學偉
楊正宏
Subjects
資訊處
國際醫學資訊研討會論文集
Abstract
基因連續性分析(Serial Analysis of Gene Expression,
SAGE)是一種利用分子生物學方法從cDNA 中獲得一
連串短序列(tag)來分析基因表現量的技術。透過此種
技術,生物學家們可以廣泛地分析各種現有的生物資
料庫樣本的基因表現資料。有鑑於現有的SAGE 分析
平台提供的分析結果,只能提供單組比較而無法作跨
組比較,無法完善地滿足需求。因此,我們根據NCBI
上的SAGEmap 所提供之資料庫,在本次研究中提出
一個簡易且便利的分析工具軟體。透過本工具軟體,
我們提供一個獨特地多群組分析方式,並且呈現一個
明顯易懂的視覺化圖表,作為生物學家分析各種基因
表現之分析平台。
SAGE(Serial Analysis of Gene Expression) is a
technique analyzing a series of tags from the cDNA for
its gene expression. Application of such technology,
biologists can analyze the relative gene expression of
many samples in silico. To date, some visible platforms
only offer the simple comparison without cross-libraries
evaluation. Therefore, we propose a simple and
convenient tool for these complex analyses among
different kinds of libraries. This platform retrieves the
databases from NCBI SAGEmap and provides the
multi-groups comparison of gene expression relatively in
the output of visualization platform. Therefore, this
platform provides a useful tool for biologists’ concern on
gene expression in various SAGE libraries.
SAGE)是一種利用分子生物學方法從cDNA 中獲得一
連串短序列(tag)來分析基因表現量的技術。透過此種
技術,生物學家們可以廣泛地分析各種現有的生物資
料庫樣本的基因表現資料。有鑑於現有的SAGE 分析
平台提供的分析結果,只能提供單組比較而無法作跨
組比較,無法完善地滿足需求。因此,我們根據NCBI
上的SAGEmap 所提供之資料庫,在本次研究中提出
一個簡易且便利的分析工具軟體。透過本工具軟體,
我們提供一個獨特地多群組分析方式,並且呈現一個
明顯易懂的視覺化圖表,作為生物學家分析各種基因
表現之分析平台。
SAGE(Serial Analysis of Gene Expression) is a
technique analyzing a series of tags from the cDNA for
its gene expression. Application of such technology,
biologists can analyze the relative gene expression of
many samples in silico. To date, some visible platforms
only offer the simple comparison without cross-libraries
evaluation. Therefore, we propose a simple and
convenient tool for these complex analyses among
different kinds of libraries. This platform retrieves the
databases from NCBI SAGEmap and provides the
multi-groups comparison of gene expression relatively in
the output of visualization platform. Therefore, this
platform provides a useful tool for biologists’ concern on
gene expression in various SAGE libraries.
File(s)
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Name
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Size
1.45 MB
Format
Adobe PDF
Checksum
(MD5):ed57219d2ed2a182b078faf3b3e98651